Microbiology

Course goals

Leerdoelen:
Tijdens deze cursus kom je zowel theoretisch als praktisch in aanraking met de wereld van micro-organismen. Na afloop van de cursus kun je:

• een- en meercellige micro-organismen zoals bacteriën, archaea, protisten, gisten en schimmels, alsmede virussen, classificeren op basis van genetica, cellulaire structuur en metabolisme
• onderscheidende karakteristieken beschrijven van de genetica, cellulaire structuur en metabolisme van micro-organismen
• diverse rollen beschrijven die micro-organismen spelen in hun habitat aan de hand van genotype en fenotype, alsmede uitleggen hoe ze inspelen op veranderende omstandigheden
• karakteristieken beschrijven van verschillende interactievormen tussen micro-organismen onderling en met organismen uit het dierenrijk en uitleggen hoe deze mechanismen bestudeerd worden
• elementaire bioinformatica gebruiken om micro-organismen te bestuderen
• eenvoudige microbiologische technieken uitvoeren
• primaire literatuur op het gebied van micro-organismen lezen en begrijpen
• wetenschappelijke data mondeling en schriftelijk presenteren zowel voor medestudenten als voor een breder publiek.

 
Vaardigheden
Uitvoeren van de onderzoekscyclus en verschillende vormen van wetenschappelijke communicatie.
 

Vaardigheden	Onderdeel van de cursus	Expliciet getoetst?
Schrijven	x	x
Mondeling presenteren	x	x
Omgaan met data	x	x
Praktische onderzoeksvaardigheden	x	x
Onderzoeksvaardigheden	x
Samenwerken	x
Kritisch denken	x
Loopbaanoriëntatie
Interdisciplinariteit

 
 

Content

Ingangseisen
De eerstejaars cursussen Evolutie en biodiversiteit, Moleculaire biologie, Planten en micro-organismen of vergelijkbare cursussen. Deze cursus kan niet gevolgd worden door studenten die een voldoende hebben gehaald voor de cursus Microbiële Interactie (B-B2MINT10).

Studie-interesserichting
De cursus is onderdeel van de studie-interesserichting Microbiologie en wordt aanbevolen voor Ecologie en Natuurbeheer.

Taal
De voertaal in de cursus is Nederlands. De leerstof wordt aangeboden in het Engels en Nederlands.

Inhoud
In de wereld waarin wij leven bevinden zich talloze micro-organismen, zoals bacteriën, archaea, protisten, gisten en schimmels, alsmede virussen. Deze zijn onlosmakelijk verbonden met het functioneren van dieren, planten en ecosystemen. Om micro-organismen en de relatie met hun omgeving beter te begrijpen is het van essentieel belang om de samenhang tussen hun genetische opbouw, regulatiemechanismen en cellulaire structuren te bestuderen. Deze processen kunnen verrassend afwijken van wat er gebeurt in dierlijke cellen.

In de eerste periode van de cursus maken de studenten kennis met de verschillende groepen micro-organismen en leren ze de samenhang tussen genotype en fenotype, alsmede de relatie tussen cellulaire structuren en hun functie voor het micro-organisme. Verder gaan ze dieper in op de mechanismen die micro-organismen hebben ontwikkeld om zich aan te passen aan wisselende omstandigheden, inclusief het leven in en op hogere organismen, zoals plant en dier.

Dit alles zal in vijf thema’s worden behandeld, te weten:

• Microbiële diversiteit,evolutie en adaptatie
• Microbiële genetica: van genoom tot fenotypes
• Microbiële celbiologie: structuur en functie
• Microbiële metabole paden, regulatie en groei
• Microbiële interacties: symbiose, competitie en samenwerking

Er zullen werkcolleges zijn om met de leerstof te oefenen en twee practicumvormen. Tijdens het computerpracticum leren studenten elementaire bioinformatica gebruiken om micro-organismen te bestuderen. Tijdens het laboratoriumpracticum leren studenten een aantal eenvoudige microbiologische technieken, waaronder de Gram-kleuring en het gebruik van selectieve en electieve media.

In de laatste weken van de cursus wordt in groepsverband onderzoek gedaan naar artikelen die gezien kunnen worden als mijlpalen op het gebied van de microbiologie. De studenten zullen een artikel naar keuze analyseren en plaatsen in een groter geheel aan de hand van de geleerde stof in de eerste periode. Daarnaast wordt geoefend met het presenteren van wetenschappelijke kennis op een duidelijke en aantrekkelijke manier.

Onderwijsvormen
De cursus omvat colleges, kennisclips, werkcolleges, computer- en laboratoriumpractica en een groepsopdracht. Er wordt geoefend met verschillende vormen van wetenschappelijke communicatie.

Toetsing
De cursus is voldoende afgerond als je een voldoende (5,5 of hoger) haalt als eindcijfer. De onderdelen tellen als volgt mee:

• Toets:                        50%
• Practica:                    20%
• Groepsopdracht:       20%
• Blackboard toetsen:  10%

Actieve deelname aan werkcolleges, practica en groepsopdracht is verplicht om te voldoen aan de inspanningsverplichting. Het cijfer voor de toets, het gemiddelde cijfer voor de practica, en het cijfer voor de groepsopdracht moeten ieder 5,50 of hoger zijn. Wanneer één van die cijfers lager is dan een 5,50 en het eindcijfer van de cursus is hoger dan een 4, komt de student in aanmerking voor een herkansing van de toets of voor een vervangende opdracht.