Molecular microbiology

Course goals

Leerdoelen
In deze cursus wordt het belang van micro-organismen in de natuur en voor de mens behandeld. Centraal staan de moleculaire mechanismen die micro-organismen gebruiken om te functioneren. Daarnaast ontwikkel je vaardigheden met betrekking tot het uitvoeren van biologisch onderzoek en het presenteren van resultaten.

Aan het einde van de cursus kun je:

• de rol van micro-organismen in de natuur, gezondheid, wetenschap en industrie aangeven en uitleggen hoe wetenschappelijk onderzoek bijdraagt tot het begrip en uitbouwen van deze rol,
• de moleculaire en cellulaire opbouw en mechanismen micro-organismen beschrijven en vergelijken,
• moleculaire technieken die gebruikt worden in het onderzoek naar micro-organismen op schrift en in de praktijk toepassen,
• primaire literatuur over micro-organismen analyseren en presenteren,
• een onderzoekscyclus verrichten,
• je eigen onderzoek of dat van anderen mondeling presenteren en schriftelijk samenvatten.

Vaardigheden

• Uitvoeren onderzoekscylus,
• Mondelinge rapportage in het Nederlands,
• Het bijhouden van een labjournaal,
• Lezen wetenschappelijk artikelen, verwerken literatuur. Het maken van een eenvoudig onderzoeksvoorstel.

Vaardigheden	Onderdeel van de cursus	Expliciet getoetst?
Schrijven	labjournaal	X
Mondeling presenteren	Opdracht	X
Omgaan met data	Onderzoeks practicum	X
Praktische onderzoeksvaardigheden	Onderzoeks practicum	X
Samenwerken	Practicum – trio’s Weekopdracht	X
Kritisch denken	Tijdens opdrachten	X
Loopbaanoriëntatie
Interdisciplinariteit

 

Content

Ingangseisen/uitsluitingen
De cursus Moleculair genetische onderzoekstechnieken is een ingangseis voor deze cursus, de cursus Microbiële Interacties of de vervangende cursus (per 24-25) Microbiologie is aanbevolen. Studenten met vergelijkbare kennis kunnen ook toegelaten worden.

Studie-interesserichting
De cursus is onderdeel van de studie-interesserichting Microbiologie. De cursus is een voorbereiding op de Masters Molecular and Cellular Life Sciences en Environmental Biology en is ook interessant voor studenten die kiezen voor BioInspired Innovation, Science and Business Management, Bioinformatics and Biocomplexity, en Infection and Immunity.

Taal
De voertaal en het onderwijsmateriaal is zowel in het Nederlands als in het Engels, afhankelijk van de docent. De vragen in het tentamen zijn ook hybride, maar mogen in het geval van vragen in het Engels zowel in het Engels als in het Nederlands beantwoord worden.


Inhoud
Micro-organismen zijn enorm divers. Zij behoren tot verschillende domeinen van het leven, zijn zeer talrijk qua aantal soorten en individuen, en vervullen een dominante rol in de natuur. Zo kunnen zij primaire producenten, opruimers van (an)organisch afval, symbionten of ziekte-verwekkers zijn. Daarnaast bieden micro-organismen of hun componenten ons ongekende mogelijkheden tot toepassingen, zowel in industriële processen, als in de geneeskunde en bij het verbeteren van het milieu. Kortom, bewust of onbewust voeren we dagelijks strijd met deze micro-organismen of maken juist van hen gebruik.
Micro-organismen zijn in tegenstelling tot wat men intuïtief zou kunnen denken zeer complex. Cellen van een cultuur kunnen verschillende functies vervullen en verschillend reageren op signalen, waarbij zij zich aanpassen aan hun omgeving. Ook vindt er uitgebreide communicatie tussen cellen plaats, inclusief genetische uitwisseling, en functioneren micro-organismen vaak samen met andere organismen. Door deze processen te bestuderen kunnen we hun rol in de natuur en gezondheid begrijpen en worden er nieuwe toepassingsgebieden ontdekt.
In de eerste 6 weken van de cursus worden er aan de hand van (gast)colleges, primaire literatuur, werkcolleges en weekopdrachten voorbeelden gegeven van de moleculaire mechanismen achter een aantal belangrijke processen in groei, differentiatie, adaptatie en interactie van micro-organismen onderling en met hun omgeving. Hierbij worden verschillende soorten actueel onderzoek belicht, van fundamenteel tot toegepast. Dit deel wordt afgerond met een schriftelijke toets. In de laatste 4 weken van de cursus wordt praktisch onderzoek gedaan (in koppels of trio’s), waarbij de studenten bijdragen aan het lopende onderzoek binnen de onderzoeksgroep Moleculaire Microbiologie.

Werkvormen
(gast) colleges, werkcolleges, opdrachten en een onderzoekspracticum.

Toetsing
De cursus is voldoende afgerond als je een voldoende (5,5 of hoger) haalt als eindcijfer. De onderdelen tellen als volgt mee:

• Tentamen:              45%
• Weekopdrachten:      15%
• Practicum:              40%

Deelname aan alle contactmomenten is verplicht en er wordt van iedereen een actieve bijdrage aan de opdrachten en het practicum verwacht. Alle onderdelen moeten met minimaal een 5,5 of hoger zijn afgerond.
De vragen in het tentamen zijn zowel in het Nederlands als in het Engels, afhankelijk van de docent. De Engelse vragen mogen zowel in het Engels als in het Nederlands beantwoord worden.