Spatial evolutionary ecology

Course goals

Leerdoelen

• Begrip van belangrijke verklarende processen voor biogeografische patronen, inclusief evolutionair, abiotische, biotische en antropogeen gedreven processen, in relatie tot verschillende taxonomische groepen
• Het kwantitatief in kaart brengen en leren werken met (big) data over multivariate processen
• Fundamenteel begrip en toepassing van methodes inzake Species Distribution Modelling
• Toetsen van biogeografische relaties aan de hand van belangrijke biogeografische processen en het maken van de koppeling naar het maatschappelijk belang daarvan (uitsterven van soorten, invasieve soorten, etc.)

Vaardigheden

• Multivariate analyses middels R
• Species Distribution modelling in R
• Samenwerken om een opdracht uit te werken en te presenteren
• Interdisciplinair denken om een complex probleem op te lossen
• Data ophalen uit externe bronnen, valideren en gebruiken
• Kwantitatief in kaart brengen en leren werken met (big) data
• Mondelinge presentaties  en programmering

 

Vaardigheden	Onderdeel van de cursus	Expliciet getoetst?
Schrijven
Mondeling presenteren	x	x
Omgaan met data	x	x
Praktische onderzoeksvaardigheden
Onderzoeksvaardigheden	x	x
Samenwerken	x	x
Kritisch denken	x	x
Loopbaanoriëntatie
Interdisciplinariteit	x	x

 

Content

Ingangseisen
Evolutie en Biodiversiteit, Evolutie 2 en Voortgezette statistiek en R. Het gevolgd hebben van de cursus Ecologie 2 wordt aanbevolen.

Studie-interesserichting
De cursus is onderdeel van de studie-interesserichtingen Evolutie & Biodiversiteit en Ecologie en Natuurbeheer.

Taal
Colleges, werkcolleges en computerpractica zullen hoofdzakelijk in het Engels worden gegeven. Het tentamen is in het Nederlands, maar mag ook in het Engels beantwoord worden. Verdere toetsing (poster, presentatie) is verplicht in het Engels.

Werkvormen
Colleges, werkcolleges, computerpractica

Inhoud
De N3 cursus Ruimtelijke Evolutionaire Ecologie gaat in op het begrijpen en in kaart brengen van de grote ruimtelijke patronen van biodiversiteit en daarbij de koppeling te maken tussen het verleden, het heden en de toekomst. De nadruk in de theoretische component ligt op het begrijpen van voorkomen van taxa in licht van biogeografische processen, zoals evolutie, abiotiek, biotiek en klimaatverandering; en op verschillende grote schaalniveaus, onder andere de Nederlandse, Europese en Zuid-Amerikaanse gebieden. Daarnaast wordt in de cursus ook aandacht gegeven aan het kwantitatief analyseren van deze patronen middels computationele technieken, multivariate analyses en species distribution modelling, waarbij niet alleen de vaardigheden maar ook de theoretische achtergrond de revue passeert.
De praktische component van de cursus focust zich op het herkennen, analyseren en toetsen van verspreidingspatronen van diverse soorten, zoals Nederlandse plantensoorten en tropische bomen. Met behulp van Species Distribution Modelling technieken in R, worden mogelijke relaties in kaart gebracht en getoetst en wordt er aangestuurd op interpretatie.
De cursus bouwt verder op de opgedane kennis uit N1&N2 Ecologie, N2 Evolutie en N2 Taxonomie en Identificatie en bereidt voor/sluit aan op de N3 Biodiversiteit en Landschap, N3 Tropische Ecologie (voorheen Internationaal Natuurbeheer), N3 Evolutie en op het werken in het Nederlandse en Europese Groene Werkveld in (ecologische adviesbureaus). REE richt zich op verspreidingspatronen van taxa op grote schaalniveaus, in contrast tot de N3 cursus Biodiversiteit en Landschap, die zich meer richt op vegetatiepatronen op lokale tot regionale schaal in combinatie met praktische vaardigheden in het veldonderzoek. De cursus kent een duidelijk theoretisch karakter, waarbij voorkennis van programmeertaal R een noodzakelijkheid is.

Globale opzet

• Week 1         Achtergrond , technieken en interpretatie van SDM
• Week 5         Tentamen SDM a.d.h.v. testdataset
• Week 5-8      Groepsonderzoeksproject
• Week 9         Afronding en eindsymposium

Toetsing                   
De cursus is voldoende afgerond als je een voldoende (5,5 of hoger) haalt als eindcijfer. Alle individuele onderdelen dienen met een 5,5 of hoger te worden afgerond om de cursus te kunnen halen. De onderdelen tellen als volgt mee:

• Tentamen:              40%            individueel
• Poster:                    30%            gezamenlijk
• Posterpresentatie:    20%            gezamenlijk
• Projectbijdrage:       10%            individueel    

Studiemateriaal
Verplicht:

• Studiemateriaal aangeboden via Brightspace